蜜蜂之消化系統是由消化管 (alimentary canal) 組成,消化管分前腸 (fore-gut) 、中腸(mid-gut)及後腸 (hind-gut) 三部份。前腸包含咽喉 (pharynx)、食道 (oesophagus)、蜜囊(honey stomach) 三部,咽喉緊接口器後方,是消化管之最前方,食道是一肌肉壁之細長管,食物在口器咀嚼時拌隨唾腺 (salivary gland) 分泌之唾液,易於進入並通過咽喉及食道,蜜囊是貯存蜜汁和水分的地方,工蜂之蜜囊伸縮性很大,其容積可擴大至60立方毫米,蜂王及雄蜂之蜜囊則不發達。 蜜囊之後至腹腔前端部分之腸道是為中腸,為蜜蜂消化食物及吸收營養之主要器官,腸壁白色多皺褶,腸壁細胞具消化和吸收功能,中腸與後腸交界處著生有馬氏管 (Malpighian tubules) ,後腸前端部分為彎曲細長之小腸,凡中腸未消化之食物經小腸繼續消化和吸收,最後剩餘之食物殘渣經直腸而排出體外。
蜜蜂之生殖系統因生殖能力不同而有差異,玆將蜂王、工蜂與雄蜂分別簡述如下:
蜂王之生殖系統主由卵巢 ( ovary ) 、輸卵管 ( oviduct ) ﹑ 貯精囊 (spermatheca)、陰道(vagina) 等部構成。卵巢左右各一,大形呈梨狀,內含一百餘條微卵管 (ovariole),卵即在微卵管形成,成熟卵由卵巢進入側輸卵管,兩側輸卵管會合成一條中輸卵管,卵經此再通過陰道,而由生殖孔排出,陰道上方有一球形貯精囊,蜂王與雄蜂交配後,雄蜂之精液即貯存於此,供一生使用 。貯精囊以一小管稱貯精囊管(spermathecalduct) 與陰道相連,貯精囊管末端尚具貯精囊腺(spermathecal gland) 一對。
工蜂之生殖系統與蜂王相似,但卵巢甚退化,僅具數條微卵管,毒囊則甚發達。
蜜蜂之神經系統亦如一般昆蟲,中央神經系由腦 (brain) 及腹神經索 (ventral nerve cord)構成,腦在頭部位於咽喉上方,為神經中樞,腹神經索則包含食道下神經球 (suboesopha gealganglion) 、二對胸神經球、及四對腹神經球,各有神經連至所在環節及附器。
蜜蜂之感覺器官甚為發達,視覺器即為單眼及複眼,對光之感覺與人類視覺不同,蜜蜂只能分辨黃、青、藍及紫外線四種顏色,無法區別橙、黃、綠三色,蜜蜂是紅色盲,蜜蜂這種辨別光線能力乃和自然界花朵顏色相適應,蜜蜂複眼尚能辨識偏光,故當太陽被雲或其他物體遮住時,只要能看到一角藍天,便能由反射的偏光而知太陽的方位。
蜜蜂的觸覺和嗅覺器亦極發達,這是由分布全身的感覺毛及觸角末端鞭節上的許多圓錐形嗅覺器及板狀嗅覺器所職司。